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过去,人们关于肺部的意识是肺部没受到感染时是无菌的。但是越来越多的证据表明,健康肺部含有常驻菌群。许多研究将慢性肺病的发展跟肺部微生物组的改变关联起来,例如囊性纤维化CF或慢性阻塞性肺病COPD。但是肺部微生物组与疾病的复杂关系还有待阐明。
健康肺部的表面是一个动态的环境。来自口鼻的残渣和微生物不断进入这一呼吸器官,而支气管的纤毛细胞能通过有节奏的运动,去除这些残渣和入侵的细菌,肺泡巨噬细胞也在时刻准备着摧毁不受欢迎的外来物。由于肺部缺少适宜细菌生活的粘膜,所以肺部微生物组比口腔微生物组的密度少大约一千倍。有文章指出,肺部微生物组似乎源自于口腔微生物组,这些细菌能够在肺部的特殊环境下生存。其中,链球菌、Prevotella和Veillonella是健康肺部最常见的细菌。
近来研究显示,慢性肺病与肺部微生物组受到干扰有关。研究人员发现,随着患者的疾病发展,他们肺部的微生物组多样性降低,而微生物的总密度保持不变。研究认为这种改变是抗生素造成的,抗生素治疗通常是CF患者所必须的。然而,2013年肺部HIV微生物组计划的成员在《美国呼吸与重症医学杂志》杂志上发表了一个出人意料的发现,与不吸烟的健康人相比,健康吸烟者的肺部微生物组并没有出现显著差异。肺部HIV微生物组计划旨在研究健康肺部的微生物组,并在此基础上分析HIV感染者肺部发生的改变。目前,肺炎、流感或肺结核对肺部微生物组的影响的相关研究还是相对较少的。
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