肠球菌（学名：Enterococcus），是厚壁菌门的乳酸菌属，革兰氏阳性球菌。经常以成对（双球菌）或短链方式存在。从形态上与链球菌属很难区分。在人类肠道里有两种常见偏利共生肠球菌：粪肠球菌(90-95%)和屎肠球菌(5-10%)。