查看“ClinVar”的源代码

{{NoteTA
|G1=LifeSciences
|G2=Medicine
}}
{{Infobox website
| name            = ClinVar
| logo            = 
| screenshot      = 
| caption         = ClinVar 官方主页截图
| url             = [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/ www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar]
| owner           = [[美国国家生物技术信息中心]] (NCBI)
| type            = 基因变异临床意义数据库
| registration    = 可选
| launch_date     = 2013年
}}

'''ClinVar''' 是由美国[[国家生物技术信息中心]]（NCBI）维护的一个公开、免费的生物信息学数据库。其核心目的是收集并整合全球范围内关于**人类基因变异**与其**临床表现（疾病）**之间关系的证据。

在精准医疗和基因检测领域，ClinVar 被视为判断变异点位是否具有“致病性”的核心参考标准。医生和生物信息学家利用该数据库来解读 NGS 检测发现的突变（如您在报告中看到的 MET 或 TP53 突变）是否具有临床指导意义。

== 核心功能与机制 ==
ClinVar 采用“众包”模式，接收来自全球各地的临床实验室、科研机构和专家小组提交的数据。
# '''变异解释提交'''：实验室提交特定变异（Variant）与特定表型（Phenotype）的关系，并附带证据等级。
# '''整合与对齐'''：ClinVar 将不同机构对同一变异的解释进行汇总，方便用户对比。
# '''共识达成'''：当多个权威机构对某一变异达成一致意见时，该变异的解释置信度会提高。

== 临床意义分级 (Clinical Significance) ==
ClinVar 对变异的致病性通常分为以下五类（基于 [[ACMG]] 指南）：
* '''致病 (Pathogenic)'''：已有确凿证据表明该变异会导致疾病。
* '''可能致病 (Likely Pathogenic)'''：有较强证据（约 90% 概率）表明致病。
* '''临床意义不明 (VUS)'''：证据不足或相互矛盾，无法确定其临床后果。
* '''可能良性 (Likely Benign)'''。
* '''良性 (Benign)'''：已确认不会导致该疾病。

== 置信度分级（星级系统） ==
ClinVar 引入了“星级”（Review Status）来量化解释的可靠性：
* {{Icon|Star}}{{Icon|Star}}{{Icon|Star}}{{Icon|Star}} (4星)：由专家小组（Expert Panel）评审通过。
* {{Icon|Star}}{{Icon|Star}}{{Icon|Star}} (3星)：经过实践指南（Practice Guideline）验证。
* {{Icon|Star}}{{Icon|Star}} (2星)：由多个提交机构提供解释且无冲突。
* {{Icon|Star}} (1星)：仅由单个机构提交，或虽有多个机构但解释存在冲突。

== 在“智慧医生”中的应用 ==
在您的 RAG 架构方案中，ClinVar 发挥以下作用：
* '''报告解析'''：当系统识别到 `p.R175H` (TP53) 时，通过 ClinVar 接口可立即获知其为“致病性”突变。
* '''动态更新'''：如果某个原本属于 VUS（意义不明）的变异被 ClinVar 更新为“致病”，系统可以自动给曾经检出该变异的患者推送预警。

== 参见 ==
* [[NCBI]]
* [[ACMG]]
* [[二代测序]] (NGS)
* [[肿瘤新抗原]]

== 参考文献 ==
<div class="references-small">
<ref>Landrum MJ, et al. ClinVar: improving access to variant interpretations and supporting evidence. Nucleic Acids Res. 2018.</ref>
<ref>Rehm HL, et al. ClinVar: an evolving ensemble for genomic medicine. Hum Mutat. 2015.</ref>
</div>
{{Reflist}}

[[Category:生物信息学数据库]]
[[Category:医学数据库]]
[[Category:基因组学]]