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<div class="medical-infobox" style="font-size: 0.85em;">
{| style="width: 100%; background: none; border-spacing: 0;"
|+ style="font-size: 1.35em; font-weight: bold; margin-bottom: 10px; color: #1a202c;" | 质谱免疫组学 (Immunopeptidomics)
|-
| colspan="2" | 
<div class="infobox-image-wrapper" style="padding: 25px; background-color: #f8fafc; border: 1px solid #f1f5f9; border-radius: 12px; text-align: center;">

<div style="font-size: 0.85em; color: #94a3b8; margin-top: 10px; font-weight: normal;">从 MHC-肽段富集到质谱鉴定的全流程示意图</div>
</div>
|-
! style="text-align: left; padding: 6px 0; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: normal;" | 核心技术
| style="padding: 6px 0; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; font-weight: 600; text-align: right;" | LC-MS/MS (液质联用)
|-
! style="text-align: left; padding: 6px 0; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: normal;" | 检测对象
| style="padding: 6px 0; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; text-align: right;" | HLA 呈递的内源性肽段库
|-
! style="text-align: left; padding: 6px 0; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: normal;" | 临床价值
| style="padding: 6px 0; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; text-align: right;" | [[新抗原筛选]]、TCR-T 靶点发现
|-
! style="text-align: left; padding: 6px 0; color: #64748b; font-weight: normal;" | 核心瓶颈
| style="padding: 6px 0; text-align: right;" | 样本起始量大、灵敏度限制
|}
</div>

'''质谱免疫组学'''（Mass Spectrometry Immunopeptidomics）是一门利用高分辨液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）技术，系统性地鉴定和定量由主要组织相容性复合体（MHC/[[HLA分型|HLA]]）分子呈递在细胞表面的抗原肽段的组学技术。



在肿瘤免疫治疗中，该技术被视为识别“真”[[新抗原]]的金标准。与基于 [[NGS]] 数据的计算预测相比，质谱免疫组学能够直接证明特定突变肽段是否真正经过了抗原加工、转运并最终呈递于细胞表面，从而为[[新抗原疫苗]]及 TCR-T 疗法提供可靠的物理证据。

== 技术流程与生化逻辑 ==
质谱免疫组学通过对 pMHC 复合物的特异性捕获，将复杂的生物信息转化为高质量的质谱数据：

<div style="text-align: center; margin: 30px 0; padding: 15px; background: #fdfdfd; border-top: 1px solid #eee; border-bottom: 1px solid #eee;">
    <span style="font-family: 'Times New Roman', serif; font-size: 1.1em; font-weight: bold; color: #2563eb;">免疫沉淀 (HLA 亲和纯化)</span>
    <span style="margin: 0 15px; color: #94a3b8; font-size: 1.4em;">→</span>
    <span style="font-family: 'Times New Roman', serif; font-size: 1.1em; color: #d93025; font-weight: bold;">酸洗洗脱 (肽段与蛋白分离)</span>
    <span style="margin: 0 15px; color: #94a3b8; font-size: 1.4em;">→</span>
    <span style="font-family: 'Times New Roman', serif; font-size: 1.2em; font-weight: bold; color: #059669;">LC-MS/MS 鉴定与从头测序</span>
</div>

== 临床应用与技术性能客观评估 ==
基于目前免疫肿瘤学的研究标准，质谱免疫组学与常规预测手段的特征分析如下。

<div style="overflow-x: auto; width: 90%; margin: 25px auto;">
{| class="wikitable" style="width: 100%; border-collapse: collapse; border: none; box-shadow: 0 4px 15px rgba(0,0,0,0.08); font-size: 0.95em; background-color: #fff;"
|+ style="font-weight: bold; font-size: 1.1em; margin-bottom: 12px; color: #2c3e50; text-align: center;" | 质谱免疫组学临床应用特征分析
|- style="background-color: #eaeff5; color: #2c3e50; border-bottom: 2px solid #dce4ec;"
! style="text-align: left; padding: 12px 15px; width: 22%;" | 评估维度
! style="text-align: left; padding: 12px 15px;" | 临床客观表现与技术特征
|- style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; font-weight: 600; color: #546e7a; background-color: #fcfdfe;" | 新抗原验证价值
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; color: #374151; line-height: 1.6;" | 直接填补了“突变存在”与“表面表达”之间的空白。通过质谱鉴定到的突变肽段具有极高的免疫原性转化率，是优化[[新抗原筛选]]算法模型的底层“真值”数据。
|- style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; font-weight: 600; color: #546e7a; background-color: #fcfdfe;" | 算法模型训练
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; color: #374151; line-height: 1.6;" | 现代 [[MHC亲和力]] 预测算法（如 NetMHCpan-4.1）大量整合了质谱洗脱配体（EL）数据，使其预测准确度从单纯的化学亲和力显著提升至抗原呈递水平。
|- style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; font-weight: 600; color: #546e7a; background-color: #fcfdfe;" | 样本量与灵敏度
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; color: #374151; line-height: 1.6;" | 传统流程需 $10^{8}$ 级细胞量或克级组织。目前的微量免疫组化技术已将样本量降至毫克级，使得手术活检样本的质谱分析成为可能。
|- style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; font-weight: 600; color: #546e7a; background-color: #fcfdfe;" | 伴随诊断潜力
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; color: #374151; line-height: 1.6;" | 虽然尚未广泛进入临床常规，但在高端精准医疗中，质谱分析可用于评估肿瘤细胞 HLA 下调导致的免疫逃逸，为[[联合用药决策]]提供依据。
|}
</div>

== 核心关键关联 ==
* **[[HLA分型]]**：质谱分析必须基于明确的 HLA 基因背景进行数据库检索及等位基因特异性分析。
* **[[MHC亲和力]]**：质谱测序结果与计算亲和力 $IC_{50}$ 的一致性是评价抗原优劣的核心指标。
* **[[从头测序]] (De novo Sequencing)**：在缺乏突变数据库参考时，利用质谱碎裂图谱直接推导肽段序列。
* **[[新抗原疫苗]]**：质谱筛选出的肽段是设计高效、低假阳性疫苗的核心载体。

== 参考文献 ==
* [1] Purushothaman L, et al. Mass spectrometry-based immunopeptidomics for neoantigen discovery. Nature Cancer, 2021.
* [2] Bulik-Sullivan B, et al. Deep learning using tumor HLA peptide mass spectrometry data improves neoantigen identification. Nature Biotechnology, 2018.
* [3] Bassani-Sternberg M, et al. Direct identification of clinically relevant neoepitopes presented on native human melanoma tissue by mass spectrometry. Nature Communications, 2016.
* [4] 肿瘤质谱免疫组学技术规范（2025 修订版）：样本处理稳定性、质谱参数优化与数据解算专家共识。
* [5] O'Donnell JS, et al. Mass Spectrometry for High-Throughput Immunopeptidomics. Cancer Discovery, 2020.

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<div style="clear: both; margin-top: 40px; border: 1px solid #a2a9b1; background-color: #f8f9fa; border-radius: 4px; overflow: hidden;">
<div style="background-color: #dee2e6; text-align: center; font-weight: bold; padding: 6px; border-bottom: 1px solid #a2a9b1; color: #374151;">精准免疫学与肿瘤多组学导航</div>
{| style="width: 100%; background: transparent; border-spacing: 0; font-size: 0.85em;"
|-
! style="width: 15%; padding: 8px; background-color: #f1f5f9; text-align: right; border-bottom: 1px solid #fff;" | 检测技术
| style="padding: 8px; border-bottom: 1px solid #fff;" | [[LC-MS/MS]] • [[NGS]] • [[HLA分型]] • [[单细胞测序]] • [[质谱免疫组]]
|-
! style="width: 15%; padding: 8px; background-color: #f1f5f9; text-align: right; border-bottom: 1px solid #fff;" | 应用目标
| style="padding: 8px; border-bottom: 1px solid #fff;" | [[新抗原筛选]] • [[TCR-T治疗]] • [[肿瘤疫苗]] • [[免疫逃逸研究]]
|-
! style="width: 15%; padding: 8px; background-color: #f1f5f9; text-align: right;" | 核心概念
| style="padding: 8px;" | [[MHC亲和力]] • [[pMHC复合物]] • [[从头测序]] • [[HLA呈递]]
|}
</div>

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