查看“外显子测序”的源代码

<div style="padding: 0 4%; line-height: 1.8; color: #1e293b; font-family: 'Helvetica Neue', Helvetica, 'PingFang SC', Arial, sans-serif; background-color: #ffffff; max-width: 1200px; margin: auto;">

    <div style="margin-bottom: 30px; border-bottom: 1.2px solid #e2e8f0; padding-bottom: 25px;">
        <p style="font-size: 1.1em; margin: 10px 0; color: #334155; text-align: justify;">
            <strong>外显子测序</strong>（Whole Exome Sequencing, WES）是一种利用高通量测序技术，专门针对基因组中编码蛋白质的区域（即<strong>[[外显子]]</strong>）进行序列测定的策略。虽然外显子区域仅占人类全基因组的约 <strong>1-2%</strong>（约 30Mb），但却包含了约 <strong>85%</strong> 的已知致病突变。通过序列捕获技术将外显子 DNA 从复杂的基因组中富集出来进行深度测序，WES 成为了发现<strong>[[孟德尔遗传病]]</strong>致病基因和癌症体细胞突变最高效、最具性价比的手段，填补了全基因组测序（WGS）高成本和基因芯片（Array）低分辨率之间的空白。
        </p>
    </div>

    <div class="medical-infobox mw-collapsible mw-collapsed" style="width: 100%; max-width: 320px; margin: 0 auto 35px auto; border: 1.2px solid #bae6fd; border-radius: 12px; background-color: #ffffff; box-shadow: 0 8px 20px rgba(0,0,0,0.05); overflow: hidden;">
        
        <div style="padding: 15px; color: #1e40af; background: linear-gradient(135deg, #e0f2fe 0%, #bae6fd 100%); text-align: center; cursor: pointer;">
            <div style="font-size: 1.2em; font-weight: bold; letter-spacing: 1.2px;">外显子测序</div>
            <div style="font-size: 0.7em; opacity: 0.85; margin-top: 4px; white-space: nowrap;">Whole Exome Sequencing (点击展开)</div>
        </div>
        
        <div class="mw-collapsible-content">
            <div style="padding: 25px; text-align: center; background-color: #f8fafc;">
                <div style="display: inline-block; background: #ffffff; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 12px; padding: 20px; box-shadow: 0 4px 10px rgba(0,0,0,0.04);">
                    [[Image:Exome_Capture_Workflow.png|100px|探针捕获外显子流程示意]]
                </div>
                <div style="font-size: 0.8em; color: #64748b; margin-top: 12px; font-weight: 600;">"大海捞针"式的精准捕获</div>
            </div>

            <table style="width: 100%; border-spacing: 0; border-collapse: collapse; font-size: 0.85em;">
                <tr>
                    <th style="text-align: left; padding: 6px 12px; background-color: #f1f5f9; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; width: 40%;">英文缩写</th>
                    <td style="padding: 6px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #0f172a;">WES</td>
                </tr>
                <tr>
                    <th style="text-align: left; padding: 6px 12px; background-color: #f1f5f9; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">覆盖范围</th>
                    <td style="padding: 6px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #1e40af;">~1-2% 基因组 (编码区)</td>
                </tr>
                <tr>
                    <th style="text-align: left; padding: 6px 12px; background-color: #f1f5f9; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">核心技术</th>
                    <td style="padding: 6px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #0f172a;">[[液相杂交捕获]] (Capture)</td>
                </tr>
                <tr>
                    <th style="text-align: left; padding: 6px 12px; background-color: #f1f5f9; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">数据量</th>
                    <td style="padding: 6px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #0f172a;">通常 6-12 Gb (100X)</td>
                </tr>
                <tr>
                    <th style="text-align: left; padding: 6px 12px; background-color: #f1f5f9; color: #475569; border-bottom: 1px solid #e2e8f0;">核心优势</th>
                    <td style="padding: 6px 12px; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; color: #b91c1c;">高性价比 (Cost-Effective)</td>
                </tr>
                <tr>
                    <th style="text-align: left; padding: 6px 12px; background-color: #f1f5f9; color: #475569;">首个应用</th>
                    <td style="padding: 6px 12px; color: #1e40af;">米勒综合征 (2010)</td>
                </tr>
            </table>
        </div>
    </div>

    <h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">技术原理：捕获与富集 (Capture & Enrich)</h2>
    
    <p style="margin: 15px 0; text-align: justify;">
        与全基因组测序（WGS）直接测序所有 DNA 不同，WES 增加了一个关键的<strong>“富集”</strong>步骤。
    </p>

    <div style="overflow-x: auto; margin: 30px auto; max-width: 100%;">
        <table style="width: 100%; border-collapse: collapse; border: 1.2px solid #cbd5e1; font-size: 0.9em; text-align: left;">
            <tr style="background-color: #f1f5f9; border-bottom: 2px solid #0f172a;">
                <th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #0f172a; width: 20%;">步骤</th>
                <th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #475569;">操作描述</th>
                <th style="padding: 12px; border: 1px solid #cbd5e1; color: #1e40af;">目的</th>
            </tr>
            <tr>
                <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600; background-color: #ffffff;">1. 打断 (Fragmentation)</td>
                <td style="padding: 8px; border: 1px solid #cbd5e1;">利用超声波将基因组 DNA 打断成 150-300bp 的片段，并加上接头 (Adapters)。</td>
                <td style="padding: 8px; border: 1px solid #cbd5e1;">构建文库。</td>
            </tr>
            <tr>
                <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600; background-color: #f8fafc;">2. 杂交 (Hybridization)</td>
                <td style="padding: 8px; border: 1px solid #cbd5e1;">加入设计好的、带有生物素标记的<strong>[[RNA探针]]</strong>（Probes）。这些探针与外显子区域互补配对。</td>
                <td style="padding: 8px; border: 1px solid #cbd5e1;">特异性识别目标区域。</td>
            </tr>
            <tr>
                <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600; background-color: #ffffff;">3. 捕获 (Capture)</td>
                <td style="padding: 8px; border: 1px solid #cbd5e1;">加入<strong>[[链霉亲和素磁珠]]</strong>，磁珠通过结合生物素，将“探针-外显子 DNA”复合物从溶液中“钓”出来。</td>
                <td style="padding: 8px; border: 1px solid #cbd5e1;">物理分离目标 DNA。</td>
            </tr>
             <tr>
                <td style="padding: 10px; border: 1px solid #cbd5e1; font-weight: 600; background-color: #f8fafc;">4. 洗脱与测序</td>
                <td style="padding: 8px; border: 1px solid #cbd5e1;">洗去未结合的内含子和非编码区 DNA，将富集到的外显子 DNA 进行 PCR 扩增并上机测序。</td>
                <td style="padding: 8px; border: 1px solid #cbd5e1;">获得序列信息。</td>
            </tr>
        </table>
    </div>

    <h2 style="background: #f1f5f9; color: #0f172a; padding: 10px 18px; border-radius: 0 6px 6px 0; font-size: 1.25em; margin-top: 40px; border-left: 6px solid #0f172a; font-weight: bold;">巅峰对决：WES vs. WGS</h2>
    
    <div style="margin-bottom: 25px; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 8px; padding: 20px; background-color: #f8fafc;">
        <h3 style="margin-top: 0; color: #1e40af; font-size: 1.1em; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;">为什么不直接测全基因组？</h3>
        <p style="text-align: justify; color: #334155;">
            尽管 <strong>[[全基因组测序]] (WGS)</strong> 成本在下降，但 WES 依然占据临床主流，主要基于“二八定律”：
        </p>
        <ul style="margin: 5px 0; padding-left: 20px; color: #475569;">
            <li><strong>测序深度 (Depth)：</strong> 同样的成本，WES 可以测到 <strong>100X-200X</strong> 的深度，而 WGS 通常只有 30X。对于检测癌症样本中低频的体细胞突变，高深度的 WES 更具优势。</li>
            <li><strong>数据存储：</strong> WES 数据量仅为 WGS 的 1/10，分析和存储成本大幅降低。</li>
            <li><strong>临床解释：</strong> 目前医学界对非编码区（Introns/Intergenic regions）突变的解释能力有限，WES 聚焦于功能明确的蛋白编码区，临床解读更直接。</li>
        </ul>
        [[Image:WES_vs_WGS_Coverage_Comparison.png|100px|WES高深度聚焦与WGS广覆盖对比]]
    </div>

    <div style="margin-bottom: 25px; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 8px; padding: 20px; background-color: #fff1f2;">
        <h3 style="margin-top: 0; color: #b91c1c; font-size: 1.1em; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;">WES 的局限性 (盲区)</h3>
        <ul style="margin: 5px 0; padding-left: 20px; color: #881337;">
            <li><strong>结构变异 (SV) 难检测：</strong> 由于是捕获短片段，WES 很难检测大片段的缺失、重复或倒位。</li>
            <li><strong>捕获偏差：</strong> GC 含量高的区域探针杂交效率低，导致覆盖不均（Drop-out）。</li>
            <li><strong>非编码区缺失：</strong> 无法检测增强子、启动子或深度内含子区域的致病突变。</li>
        </ul>
    </div>

    <div style="font-size: 0.92em; line-height: 1.6; color: #1e293b; margin-top: 50px; border-top: 2px solid #0f172a; padding: 15px 25px; background-color: #f8fafc; border-radius: 0 0 10px 10px;">
        <span style="color: #0f172a; font-weight: bold; font-size: 1.05em; display: inline-block; margin-bottom: 15px;">学术参考文献</span>
        
        <p style="margin: 12px 0; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;">
            [1] <strong>Ng SB, Turner EH, Robertson PD, et al. (2009).</strong> <em>Targeted capture and massively parallel sequencing of 12 human exomes.</em> <strong>[[Nature]]</strong>. 2009;461(7261):272-276.<br>
            <span style="color: #475569;">[概念验证]：Jay Shendure 团队首次证明 WES 技术的可行性，并不仅限于理论。</span>
        </p>

        <p style="margin: 12px 0; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;">
            [2] <strong>Ng SB, Buckingham KJ, ..., Shendure J, Bamshad MJ. (2010).</strong> <em>Exome sequencing identifies the cause of a mendelian disorder.</em> <strong>[[Nature Genetics]]</strong>. 2010;42(1):30-35.<br>
            <span style="color: #475569;">[临床里程碑]：历史上首次利用 WES 技术成功发现了一种罕见单基因病（米勒综合征）的致病基因 <em>DHODH</em>，开启了罕见病诊断的新纪元。</span>
        </p>
        
        <p style="margin: 12px 0; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; padding-bottom: 10px;">
            [3] <strong>Bamshad MJ, Ng SB, Bigham AW, et al. (2011).</strong> <em>Exome sequencing as a tool for Mendelian disease gene discovery.</em> <strong>[[Nature Reviews Genetics]]</strong>. 2011;12(11):745-755.<br>
            <span style="color: #475569;">[权威综述]：系统总结了 WES 在孟德尔遗传病发现中的策略和优势。</span>
        </p>
    </div>

    <div style="margin: 40px 0; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 8px; overflow: hidden; font-family: 'Helvetica Neue', Arial, sans-serif; font-size: 0.9em;">
        <div style="background-color: #eff6ff; color: #1e40af; padding: 8px 15px; font-weight: bold; text-align: center; border-bottom: 1px solid #dbeafe;">
            外显子测序 (WES) · 知识图谱
        </div>
        <table style="width: 100%; border-collapse: collapse; background-color: #ffffff;">
            <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">
                <td style="width: 85px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle; white-space: nowrap;">上级技术</td>
                <td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[高通量测序]] (NGS) • [[基因组学]]</td>
            </tr>
            <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">
                <td style="width: 85px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle; white-space: nowrap;">商业试剂</td>
                <td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[Agilent]] SureSelect • [[Roche]] NimbleGen • [[Twist]] Bioscience</td>
            </tr>
            <tr style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;">
                <td style="width: 85px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle; white-space: nowrap;">应用领域</td>
                <td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">[[罕见病诊断]] • [[肿瘤新抗原]]筛选 • [[家系分析]] (Trio analysis)</td>
            </tr>
            <tr>
                <td style="width: 85px; background-color: #f8fafc; color: #334155; font-weight: 600; padding: 10px 12px; text-align: right; vertical-align: middle; white-space: nowrap;">核心逻辑</td>
                <td style="padding: 10px 15px; color: #334155;">二八定律：测 1% 的区域，解 85% 的问题</td>
            </tr>
        </table>
    </div>

</div>