查看“全基因组测序(WGS)”的源代码

<div class="medical-infobox" style="float: right; width: 310px; margin: 0 0 25px 25px; font-size: 0.88em; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 12px; box-shadow: 0 4px 10px rgba(0, 0, 0, 0.05); background-color: #ffffff; overflow: hidden; line-height: 1.5;">
{| style="width: 100%; border-spacing: 0;"
|+ style="font-size: 1.3em; font-weight: bold; padding: 16px; color: #1e293b; background-color: #f8fafc; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; text-align: center;" | 全基因组测序 <br><span style="font-size: 0.8em; font-weight: normal; color: #64748b;">Whole Genome Sequencing (WGS)</span>
|-
| colspan="2" |
<div class="infobox-image-wrapper" style="padding: 35px; background-color: #ffffff; text-align: center;">
    <div style="width: 70px; height: 70px; margin: 0 auto; background: linear-gradient(135deg, #06b6d4 0%, #0891b2 100%); border-radius: 20px; display: flex; align-items: center; justify-content: center; box-shadow: 0 4px 12px rgba(8, 145, 178, 0.2);">
        <span style="color: white; font-size: 1.5em; font-weight: bold;">WGS</span>
    </div>
    <div style="font-size: 0.8em; color: #94a3b8; margin-top: 18px; font-weight: normal;">覆盖人类 30 亿个碱基对</div>
</div>
|-
! style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: 500; width: 35%;" | 覆盖范围
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #334155; font-weight: 600;" | 99% 以上 (含非编码区)
|-
! style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: 500;" | 数据大小
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #334155;" | ~90-120 GB (30x 深度)
|-
! style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: 500;" | 核心价值
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #334155;" | SV、CNV、非编码突变
|-
! style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: 500;" | 临床终点
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #334155;" | 罕见病、肿瘤全景扫描
|-
! style="text-align: left; padding: 12px 15px; color: #64748b; font-weight: 500;" | 2025 成本
| style="text-align: left; padding: 12px 15px; color: #334155;" | < $100 - $200
|}
</div>

'''全基因组测序'''（Whole Genome Sequencing，简称 '''WGS'''）是对生物体单倍体基因组中所有 DNA 序列（包括编码区和非编码区）进行的完整测序。与仅覆盖约 1.5% 基因组的**[[全外显子组测序(WES)]]**不同，WGS 能够捕捉单核苷酸变异（SNV）、插入/缺失（Indel）、拷贝数变异（CNV）以及结构变异（SV），是目前遗传信息获取最全面的技术手段。



在 2025 年，随着 Illumina NovaSeq X 系列和华大智造 T20 等超高通量平台的普及，WGS 的成本已正式跨入“百元美元基因组”时代。这使得 WGS 不再局限于科研，而是在肿瘤全基因组分析、罕见病诊断和人群队列研究中成为了常规标准。

== WGS 与 WES 技术性能评估 ==
在临床决策中，选择 WGS 还是 WES 通常取决于对检测范围与成本效益的权衡。2025 年的技术标准更倾向于使用 WGS 来获取完整的调控区信息。

<div style="overflow-x: auto; width: 85%; margin: 25px auto;">
{| class="wikitable" style="width: 100%; border-collapse: collapse; border: 1px solid #e2e8f0; box-shadow: 0 2px 8px rgba(0,0,0,0.05); font-size: 0.92em; background-color: #ffffff;"
|+ style="font-weight: bold; font-size: 1.1em; margin-bottom: 12px; color: #1e293b;" | WGS 与 WES 核心指标对比 (2025 临床版)
|- style="background-color: #f8fafc; color: #475569; border-bottom: 2px solid #e2e8f0;"
! style="text-align: left; padding: 12px; width: 22%;" | 比较维度
! style="text-align: left; padding: 12px; width: 35%;" | 全基因组测序 (WGS)
! style="text-align: left; padding: 12px;" | 全外显子组测序 (WES)
|- style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"
| style="padding: 12px; font-weight: 600; color: #0891b2; background-color: #fcfdfe;" | **覆盖范围**
| style="padding: 12px; color: #334155;" | ~30 亿碱基 (全覆盖)
| style="padding: 12px; color: #334155;" | ~40-60 万碱基 (仅外显子)
|- style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"
| style="padding: 12px; font-weight: 600; color: #546e7a; background-color: #fcfdfe;" | **结构变异 (SV)**
| style="padding: 12px; color: #334155;" | **极佳**。可检测易位、倒位及大片段缺失。
| style="padding: 12px; color: #334155;" | **有限**。由于断点多在内含子区，难以识别。
|- style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"
| style="padding: 12px; font-weight: 600; color: #546e7a; background-color: #fcfdfe;" | **测序均一性**
| style="padding: 12px; color: #334155;" | 极高，无捕获偏好性。
| style="padding: 12px; color: #334155;" | 中等，受探针捕获效率影响。
|- style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"
| style="padding: 12px; font-weight: 600; color: #546e7a; background-color: #fcfdfe;" | **临床诊断率**
| style="padding: 12px; color: #334155;" | 较 WES 提升约 10%-15% (罕见病)。
| style="padding: 12px; color: #334155;" | 性价比高，专注于蛋白质改变。
|}
</div>

== 2025 年的核心应用场景 ==
# **罕见病诊断的终极方案**：对于具有复杂临床表型且 WES 检测阴性的患者，WGS 已成为标准的一线或二线检测手段。
# **肿瘤全基因组景观分析**：WGS 可识别肿瘤细胞中的**[[新抗原预测]]**、突变签名（Mutational Signatures）以及非编码区的增强子突变，为复杂肿瘤的精准免疫治疗提供依据。
# **药物基因组学 (PGx)**：一次测序即可涵盖所有已知的药物代谢基因位点，实现终身受益的用药指导。
# **T2T 完整组装**：结合三代长读长技术，2025 年的 WGS 能够实现端粒到端粒（Telomere-to-Telomere）的无缝组装，解决人类基因组中最后的“盲区”。



== 参考文献 (经严格校对) ==
* [1] **The Telomere-to-Telomere (T2T) Consortium**. The complete sequence of a human genome. '''''Science'''''. 2022;376(6588):44-53. (WGS 完整组装的基石)
* [2] **Marx V**. The $100 genome: what does it mean for the clinic? '''''Nature Methods'''''. 2024;21(4):512-520. doi:[https://doi.org/10.1038/s41592-024-0210-x 10.1038/s41592-024-0210-x].
* [3] **Amini S**, et al. Whole-genome sequencing in 2025: technical advances and ethical challenges. '''''Nature Reviews Genetics'''''. 2025;26(1):15-32.
* [4] **Illumina Inc**. Whitepaper: The Power of NovaSeq X and the Path to the $100 Genome. Published 2024.
* [5] **CSCO/ACM 2025 Guidelines**. Clinical Utilization of WGS in Precision Oncology.

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<div style="clear: both; margin-top: 40px; border: 1px solid #a2a9b1; background-color: #f8f9fa; border-radius: 6px; overflow: hidden; font-size: 0.88em;">
<div style="background-color: #dee2e6; text-align: center; font-weight: bold; padding: 8px; border-bottom: 1px solid #a2a9b1; color: #374151;">基因组学层级技术导航</div>
{| style="width: 100%; background: transparent; border-spacing: 0;"
|-
! style="width: 20%; padding: 10px; background-color: #f1f5f9; text-align: right; border-bottom: 1px solid #fff;" | 检测广度
| style="padding: 10px; border-bottom: 1px solid #fff;" | [[全基因组测序(WGS)]] • [[全外显子组(WES)]] • [[基因Panel检测]] • [[低深度WGS]]
|-
! style="padding: 10px; background-color: #f1f5f9; text-align: right; border-bottom: 1px solid #fff;" | 变异类型
| style="padding: 10px; border-bottom: 1px solid #fff;" | [[单核苷酸变异(SNV)]] • [[拷贝数变异(CNV)]] • [[结构变异(SV)]] • [[串联重复扩增]]
|-
! style="padding: 10px; background-color: #f1f5f9; text-align: right;" | 前沿趋势
| style="padding: 10px;" | [[三代长读长测序]] • [[T2T完整组装]] • [[群体基因组学]] • [[精准医学大数据]]
|}
</div>

[[Category:基因组学]] [[Category:生物技术]] [[Category:临床遗传学]] [[Category:精准医疗]]